Erkeklerde HPV tedavisi siğillerin vücuttan çıkarılması ve bağışıklık sisteminin güçlendirilmesi amaçlı planlanmaktadır. HPV tedavisi siğillerin yok edilmesiyle başlar. Yok edilen siğillerin tekrarlama riski olduğundan bağışıklık güçlendirici tedaviler ve günlük hayatta çok eşli cinsel hayattan kaçınma, cinsel ilişkide prezervatif kullanma ve kişisel hijyene önem verme gibi alınacak tedbrilerle devam eder. Süreç bu şekilde ilerlemediği takdirde yok edilen HPV siğilleri kişide tekrar ortaya çıkabilir.

Genital siğiller erkeklerde ilaçla, cerrahi yolla, yakma ya da dondurma işlemleri ile ortadan kaldırılabilir. Bu yöntemler arasında hastanın konforu ve en kısa sürede tedaviden cevap alabildiğimiz Cryopen teknolojisi kullanılarak yapılan dondurma işlemi ön plana çıkmaktadır.